Atomların varlığına dair birçok deney ve çalışma yapılmıştır. Atomların davranışları, kimyasal reaksiyonları, izotopları, yapıları vb. konularda pek çok deney yapılarak atom teorisi günümüze kadar gelmiştir. Ayrıca atomların görüntüleri de mikroskoplar aracılığıyla görüntülenebilmekte ve gözlemlenebilmektedir.
Atomlar birbirlerine elektrik yükleri aracılığıyla etkileşirler ve yaklaştıklarında birbirlerini iterek temas etmelerini engellerler. Bu nedenle teknik olarak bir atomun başka bir atoma dokunmasından bahsedemeyiz. Ancak pratikte, günlük yaşamda kullandığımız nesnelerin temas ettiği gibi algılanması doğaldır.